Постановлением Губернатора Ставропольского края от 10.11.1999 № 664 на Чограйском водохранилище образован государственный природный заказник краевого значения «Чограйский» (далее - заказник).

Положением о заказнике, утвержденным постановлением Правительства Ставропольского края от 02.11.2000 № 208-п, определено, что на его территории запрещаются следующие виды деятельности:

• спортивная и любительская охота и рыбная ловля;
• проезд и стоянка транспортных средств вне дорог общего пользования;
• устройство привалов, бивуаков, туристических стоянок и лагерей, иные формы отдыха населения.

В настоящее время министерством подготовлены изменения в Положение о заказнике, в соответствии с которыми на водохранилище будут определены участки для любительского рыболовства.